工伤康复住院费用一般应由工伤保险基金报销。分析：根据《工伤保险条例》，职工因工作遭受事故伤害或患职业病进行治疗，享受工伤医疗待遇。工伤康复住院费用属于工伤医疗待遇的一部分，应由用人单位缴纳的工伤保险基金支付。具体报销比例和流程可能因地区而异，需依据当地工伤保险政策执行。提醒：若工伤保险基金拒绝报销或报销比例远低于预期，可能表明问题比较严重，应及时寻求劳动监察部门或专业律师的帮助。
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处理方式：从法律角度看，工伤康复住院费用的报销主要通过工伤保险基金进行。具体处理方式包括：1. 向用人单位提交工伤认定申请及相关医疗费用单据；2. 用人单位向工伤保险经办机构申报；3. 工伤保险经办机构审核后，按规定支付医疗费用。选择方式：若用人单位已缴纳工伤保险，首选通过工伤保险基金报销；若用人单位未缴纳工伤保险，则需与用人单位协商，要求其承担医疗费用；协商不成时，可申请劳动仲裁或提起诉讼。
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具体操作：1. 提交工伤认定申请：职工应在事故发生后及时向用人单位提交工伤认定申请，并提供相关证明材料。用人单位应在规定时间内向社会保险行政部门提交工伤认定申请。2. 收集医疗费用单据：在工伤康复住院期间，注意收集所有医疗费用单据，包括住院费、治疗费、药费等。3. 申报医疗费用：用人单位应向工伤保险经办机构提交工伤认定决定书、医疗费用单据等材料，申请报销医疗费用。4. 审核与支付：工伤保险经办机构将对申报材料进行审核，确认无误后，按规定支付医疗费用给医疗机构或职工本人。若工伤保险基金拒绝支付或支付比例不当，职工可向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。